Κωδικός: 
ΒΙΟΛ-476
Εξάμηνο: 
Εαρινό
Κατεύθυνση: 
Κοινό Μάθημα των δύο κατευθύνσεων
Διδακτικές μονάδες: 
4
ECTS Μονάδες: 
6
Ώρες την εβδομάδα:
Θεωρία: 2 
Φροντιστήριο: 
2

 ΥΠΕΥΘΥΝΟΣ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ
Καθηγητής: Παύλος Παυλίδης
Email: Αυτή η διεύθυνση Email προστατεύεται από τους αυτοματισμούς αποστολέων ανεπιθύμητων μηνυμάτων. Χρειάζεται να ενεργοποιήσετε τη JavaScript για να μπορέσετε να τη δείτε.
Τηλέφωνο Γραφείου: +30 2810 394069
Τηλέφωνο Εργαστηρίου: 

Περιγραφή 

Σύντομη περιγραφή

  1. Εισαγωγη στην Βιολογία που χρειάζεται για αναλύσεις Βιοπληροφορικής. Συνήθεις “αφαιρέσεις” (abstractions)  και απλοποιήσεις που γίνονται στην βιοπληροφορική
  2. Γενική Παρουσίαση της γλωσσας R. Εξοικείωση με το r-studio
  3. Ανάλυση PWM για εύρεση σημείων πρόσδεσης μεταγραφικών παραγόντων.
  4. Απόκτηση δεδομένων από την GEO, SRA, ArrayExpress
  5. Ανάλυση Δεδομενων Μικροσυστοιχιων
    1. έλεγχος υποθέσεων. μηδενική/εναλλακτική υπόθεση
    2. χρήση του t-test
  6. Γραμμικά μοντέλα στην ανάλυση μικροσυστοιχιών
  7. Χρήση μίας ή παραπάνω explanatory variables
  8. Διαγράμματα στην R
  9. Ανάλυση πληθυσμιακών δεδομένων στην R

Προτεινόμενες Ασκήσεις

Σε κάθε μάθημα θα υπάρχουν ασκησεις, που οι φοιτητές θα πρέπει να λυνουν μέχρι την επόμενη παράδοση. Ο Βαθμός των ασκήσεων θα μετράει περιπου 30 % του συνολικού.