Κωδικός: 
ΒΙΟΛ-450
Εξάμηνο: 
Εαρινό Εξάμηνο
Τύπος Μαθήματος: 
Επιλογής
Κατεύθυνση: 
Κοινό Μάθημα των δύο κατευθύνσεων
Ιστοσελίδα Μαθήματος: 
Computational methods in Evolution
 
Διδακτικές μονάδες: 
3
ECTS Μονάδες: 
5
Ώρες την εβδομάδα:
Θεωρία: 3

Υπεύθυνος Μαθήματος

Καθηγητής:Πουλακάκης Νικόλαος
Email:Αυτή η διεύθυνση Email προστατεύεται από τους αυτοματισμούς αποστολέων ανεπιθύμητων μηνυμάτων. Χρειάζεται να ενεργοποιήσετε τη JavaScript για να μπορέσετε να τη δείτε.
Τηλέφωνο Γραφείου: +30 2810 393619
Τηλέφωνο Εργαστηρίου: +30 2810 393282

Υπεύθυνος Μαθήματος

Αναπληρωτής Καθηγητής:Λαδουκάκης Εμμανουήλ
Email: Αυτή η διεύθυνση Email προστατεύεται από τους αυτοματισμούς αποστολέων ανεπιθύμητων μηνυμάτων. Χρειάζεται να ενεργοποιήσετε τη JavaScript για να μπορέσετε να τη δείτε.
Τηλέφωνο Γραφείου: +30 2810 394067
Τηλέφωνο Εργαστηρίου: +30 2810 394074

 

Περιγραφή / Διδάσκοντες

Άλλοι Διδάσκοντες: 
Παύλος Παυλίδης (ΙΤΕ), Αγλαϊα Αντωνίου (ΕΛ.ΚΕ.Θ.Ε.)
 
  • Εύρεση επιλογής σε πολυμορφικά δεδομένα
  • Εκτίμηση της δημογραφικής ιστορίας μέσω coalescent
  • Coalescent model και συμπεράσματα από πληθυσμιακά δεδομένα
  • Εκτίμηση χρόνων απόκλισης divergence times
  • Έλεγχος υποθέσεων στη φυλογένεση
  • Στατιστική ανάλυση βιολογικών υποθέσεων (likelihood ratio tests, Akaike Information Criterion, Bayesian statistics).
  • Κατασκευή φυλογενετικών δέντρων μέσω φειδωλότητας, πινάκων αποστάσεων, πιθανοφάνειας και Μπευζιανής συμπερασματολογίας.
  • Μοντέλα νουκλεοτιδικής υποκατάστασης (gamma-distributed mutation rates, codon models and analysis of selective pressure).
  • Συγκέντρωση δεδομένων και ευθυγράμμιση αλληλουχιών
  • Ερμηνεία φυλογενετικών δέντρων
  • Εισαγωγή στη θεωρία της εξέλιξης και της πληθυσμιακής γενετικής
  • Εύρεση επιλογής σε δεδομένα από πολυμορφισμούς και απόκλιση