Μαθήματα
Πλήρες βιογραφικό σημείωμα
Εκπαίδευση
Σταδιοδρομία
ΕΠΑΓΓΕΛΜΑΤΙΚΗ ΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΑ
2016- : Αναπληρωτής Καθηγητής Μοριακής Βιολογίας & Επιγενετικής, Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης.
2013-2016: Μόνιμος Επίκουρος Καθηγητής, Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης.
2009-2013: Επίκουρος Καθηγητής επί θητεία, Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης.
2007-2009: Ερευνητής Γ’ βαθμίδας, Ινστιτούτο Μοριακής Βιολογίας και Βιοτεχνολογίας, Ίδρυμα Τεχνολογίας και Έρευνας, Ηράκλειο Κρήτης.
2009- : Συνεργαζόμενο μέλος ΔΕΠ, Ινστιτούτο Μοριακής Βιολογίας και Βιοτεχνολογίας, Ίδρυμα Τεχνολογίας και Έρευνας, Ηράκλειο.
Επιστημονικά ενδιαφέροντα
Μεταγραφική ρύθμιση γενετικών τόπων του ανοσοποιητικού στα πλαίσια της χρόνο-χωροταξικής οργάνωσης του πυρήνα του ευκαρυωτικού κυττάρου. Κύριο στόχο αποτελούν η αναγνώριση και χαρακτηρισμός πρωτεϊνικών συμπλόκων που ενέχονται σε μεγάλου εύρους χρωμοσωμικές αλληλεπιδράσεις σε κυτταρικούς πληθυσμούς του επίκτητου και εγγενούς ανοσιακού συστήματος με χρήση τεχνολογιών βιοπληροφορικής, μοριακής και κυτταρικής βιολογίας, γενετικής καθώς και τεχνικών μικροσκοπίας. Πως οργανώνεται το γονιδίωμα σαν σύνολο και πως η πυρηνική αρχιτεκτονική στο πλαίσιο διακριτών υποπυρηνικών επικρατειών ρυθμίζει τη γονιδιακή έκφραση (3D-επιγενετική);
Πρόσφατες δημοσιεύσεις
- Single-cell detection of primary transcripts, their genomic loci and nuclear factors by immuno-3D RNA/DNA FISH in T cells. Eralda Salataj, Charalampos Spilianakis, Julie Chaumeil. Front. Immunol. 2023, 14:2023 | https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1156077
- 3D Genome Organization as an Epigenetic Determinant of Transcription Regulation in T Cells. George Papadogkonas , Dionysios-Alexandros Papamatheakis and Charalampos Spilianakis. Front. Immunol. 2022, 13:921375. doi: 10.3389/fimmu.2022.921375
- The 3D enhancer network of the developing T cell genome is shaped by SATB1. Tomas Zelenka, Antonios Klonizakis, Despina Tsoukatou, Dionysios-Alexandros Papamatheakis, Sören Franzenburg, Petros Tzerpos, , Ioannis-Rafail Tzonevrakis, George Papadogkonas, Manouela Kapsetaki, Christoforos Nikolaou, Dariusz Plewczynski and Charalampos Spilianakis. Nat. Communications 2022, 13(1): 6954 doi: 10.1038/s41467-022-34345-y
- HiChIP and Hi-C Protocol Optimized for Primary Murine T Cells. Zelenka T, Spilianakis C. Methods Protoc. 2021; 4(3):49. doi: https://doi.org/10.3390/mps4030049
- SATB1-mediated chromatin landscape in T cells. Zelenka T & Spilianakis C.G. Nucleus 2020; 11: 117-131; doi: https://doi.org/10.1080/19491034.2020.1775037
- Developmental Conservation of microRNA Gene Localization at the Nuclear Periphery. Salataj E, Stathopoulou C, Hafþórsson RA, Nikolaou C, Spilianakis C.G. PLoS One 2019; 14(11):e0223759. https://doi.org/10.1371/journal. pone.0223759
- The BACH1-HMOX1 Regulatory Axis Is Indispensable for Proper Macrophage Subtype Specification and Skeletal Muscle Regeneration. Patsalos A, Tzerpos P, Halasz L, Nagy G, Pap A, Giannakis N, Lyroni K, Koliaraki V, Pintye E, Dezso B, Kollias G, Spilianakis CG, Nagy L. J Immunol. 2019; 203(6):1532-1547 . doi: https://doi.org/10.4049/jimmunol.1900553
- Myosin VI regulates gene pairing and transcriptional pause release in T cells. Zorca CE, Kim LK, Kim YJ, Krause MR, Zenklusen D, Spilianakis CG, Flavell RA. Proc Natl Acad Sci USA 2015; 112(13):E1587-1593 doi: 10.1073/pnas.1502461112
- Spatial proximity of homologous alleles and long noncoding RNAs regulate a switch in allelic gene expression. Stratigi K., Kapsetaki M., Aivaliotis M., Town T., Flavell RA., Spilianakis CG. Proc Natl Acad Sci USA 2015; 112(13):E1577-1586 doi: https://doi.org/10.1073/pnas.1502182112
- Hypersensitive site 6 of the TH2 locus control region is essential for TH2 cytokine expression. Williams A., Lee G.R., Spilianakis C.G., Hwang S.S., Eisenbarth S.C., Flavell R.A. Proc Natl Acad Sci USA 2013; 110(17): 6955-6960 doi: https://doi.org/10.1073/pnas.1304720110
