Υπεύθυνος Μαθήματος
Τηλέφωνο Γραφείου:
Τηλέφωνο Εργαστηρίου:
|
Εβδομάδα 1: Εισαγωγή στο αρχαίο DNA (3 ώρες) • Η ιστορική σημασία του αρχαίου DNA • Προκλήσεις και περιορισμοί στην ανάλυσης του αρχαίου DNA • Επισκόπηση του μαθήματος και προσδοκίες Εβδομάδα 2: Βασικές αρχές εξαγωγής DNA (3 ώρες) • Διατήρηση και αποικοδόμηση του DNA • Επιλογή δειγμάτων, δειγματοληψία και προετοιμασία δειγμάτων • Επισκόπηση των κύριων πρωτοκόλλων εξαγωγής αρχαίου DNA Εβδομάδα 3: Εργαστηριακές τεχνικές ανάλυσης αρχαίου DNA (3 ώρες) • Η Αλυσιδωτή Αντίδραση Πολυμεράσης (PCR) • Μέθοδοι προετοιμασίας γονιδιωματικών βιβλιοθηκών αρχαίου DNA • Βιοπληροφορικά εργαλεία για ανάλυση δεδομένων αρχαίου DNA Εβδομάδα 4: Αυθεντικοποίηση αρχαίου DNA και έλεγχος επιμόλυνσης (3 ώρες) • ‘Έλεγχος γνησιότητας αρχαίου DNA • Μέθοδοι ελέγχου ποσοστού επιμόλυνσης • Μελέτες περιπτώσεων (case studies) / Ομαδικές συζητήσεις / Ασκήσεις Εβδομάδα 5: Αρχαίο DNA και μελέτη ατομικών χαρακτηριστικών (3 ώρες) • Εκτίμηση γενετικού φύλου με χρήση δεδομένων αρχαίου DNA • Αντιστοίχιση σε μονογονεϊκά κληρονομούμενες απλοομάδες • Προσδιορισμός φαινοτυπικών χαρακτηριστικών - μελέτες περίπτωσης (case studies) Εβδομάδα 6: Αρχαίο DNA και μελέτη συγγένειας (3 ώρες) • Κύριες μέθοδοι εκτίμησης βαθμού συγγένειας με χρήση δεδομένων αρχαίου DNA • Βαθμοί συγγένειας και κοινωνικά στοιχεία των πληθυσμών του παρελθόντος – Μελέτες περιπτώσεων (case studies) • Χρήση της συγγένειας στην αναγνώριση ατόμων του παρελθόντος / θυμάτων πολέμων Εβδομάδα 7: Εφαρμογές του αρχαίου DNA στη μελέτη της ανθρώπινης εξέλιξης (3 ώρες) • Εξελικτικές σχέσεις μεταξύ αρχαϊκών ανθρώπων και του μοντέρνου ανατομικά ανθρώπου • Νεάντερταλς, Ντενίσοβανς και αρχαίο DNA Εβδομάδα 8: Ανίχνευση ανθρώπινων μεταναστεύσεων και πρόσμιξης με χρήση aDNA (3 ώρες) • Βιοπληροφορικά εργαλεία ανάλυσης αρχαίων γονιδιωμάτων σε πληθυσμιακό επίπεδο • Μελέτες περίπτωσης (case studies) μετανάστευσης/πρόσμιξης αρχαίων ανθρώπινων πληθυσμών. Εβδομάδα 9: Η εξέλιξη του ανθρώπου στον Ελλαδικό χώρο κατά την προϊστορία (3 ώρες) • Η μετάβαση από τους Κυνηγούς Τροφοσυλλέκτες της Μεσολιθικής Εποχής στους Γεωργούς της Νεολιθικής Εποχής στο χώρο της Ελλάδας • Αρχαία Γονιδιώματα και η Εποχή του Χαλκού στην Ελλάδα Εβδομάδα 10: Αρχαία γονιδιώματα των ιστορικών χρόνων της Ανατολικής Μεσογέιου (3 ώρες) • Μελέτες περίπτωσης (case studies) / Ομαδικές συζητήσεις Εβδομάδα 11: Αρχαία παθογόνα και ασθένειες (3 ώρες) • Αναγνώριση γονιδιωμάτων παθογόνων σε αρχαιολογικά δείγματα • Μελέτες περιπτώσεων (case studies) / Ομαδικές συζητήσεις Εβδομάδα 12: Οικοσιτοποίηση ζώων και φυτών (3 ώρες) • Σύνδεση μεταξύ οικοσιτοποίησης και μελέτης του ανθρώπινου παρελθόντος • Συνεισφορά του αρχαίου DNA στη μελέτη της οικοσιτοποίησης • Μελέτες περίπτωσης (case studies) εξημέρωσης ζώων και φυτών με χρήση αρχαίου DNA Εβδομάδα 13: Παρουσιάσεις εργασιών (3 ώρες) • Παρουσιάσεις (~15 λεπτών) από τους φοιτητές |
