Σύντομη περιγραφή

1. Εισαγωγη στην Βιολογία που χρειάζεται για αναλύσεις Βιοπληροφορικής. Συνήθεις “αφαιρέσεις” (abstractions)  και απλοποιήσεις που γίνονται στην βιοπληροφορική
2. Γενική Παρουσίαση της γλωσσας R. Εξοικείωση με το r-studio
3. Ανάλυση PWM για εύρεση σημείων πρόσδεσης μεταγραφικών παραγόντων.
4. Απόκτηση δεδομένων από την GEO, SRA, ArrayExpress
5. Ανάλυση Δεδομενων Μικροσυστοιχιων
   1. έλεγχος υποθέσεων. μηδενική/εναλλακτική υπόθεση
   2. χρήση του t-test
6. Γραμμικά μοντέλα στην ανάλυση μικροσυστοιχιών
7. Χρήση μίας ή παραπάνω explanatory variables
8. Διαγράμματα στην R
9. Ανάλυση πληθυσμιακών δεδομένων στην R

Προτεινόμενες Ασκήσεις

Σε κάθε μάθημα θα υπάρχουν ασκησεις, που οι φοιτητές θα πρέπει να λυνουν μέχρι την επόμενη παράδοση. Ο Βαθμός των ασκήσεων θα μετράει περιπου 30 % του συνολικού.