Οικολογία και Διαχείριση: Θεωρήσεις και ορισμοί. Περιβαλλοντική ηθική. Κοινωνία και διαχείριση οικοσυστημάτων. Η επιστημονική βάση της διαχείρισης οικοσυστημάτων. Ανάπτυξη και περιβάλλον. Περιβαλλοντική πολιτική. Διεθνείς συμβάσεις. Περιβαλλοντική Νομοθεσία. Εκτίμηση περιβαλλοντικών επιπτώσεων. Διαδικασίες λήψης αποφάσεων. Η έννοια της αειφορίας. Δείκτες αειφορικής ανάπτυξης

Ανάλυση χωρικών δεδομένων: Συστήματα Γεωγραφικών Πληροφοριών (GIS). Συλλογή, μετατροπή, ανάλυση και οπτικοποίηση δεδομένων. Δορυφορική τηλεπισκόπηση. Ανάλυση δορυφορικής εικόνας, φωτοερμηνεία και μέθοδοι φασματικής ταξινόμησης. Χαρτογραφικά υπόβαθρα, πηγές, λήψη και ανάλυση δορυφορικών δεδομένων. Οικολογικά μοντέλα οικοθέσης και Μοντέλα πρόβλεψης κατανομής ειδών.

Κλιματική αλλαγή: Σενάρια κλιματικής αλλαγής, Απόκριση της βιοποικιλότητας στην κλιματική αλλαγή

Γενετική ποικιλότητα: Γενετική ποικιλότητα φυτών στη Μεσόγειο. Διαχείριση φυτικών γενετικών πόρων.

Ενδημισμός: Ο ενδημισμός και η σπανιότητα των φυτών στην Μεσόγειο. In situ διαχείριση σπάνιων και ενδημικών φυτών.

Υβριδισμός: Ο υβριδισμός στη φύση και η έννοια του είδους, ζώνες υβριδισμού και ευρύτερα θεωρίες υβριδισμού. Υβριδισμός και ειδογένεση. Υβριδισμός στη Γεωργία και ο ρόλος του στο παγκόσμιο διατροφικό σύστημα.

Τριτογενή υπολείμματα: Μεσογειακά μεταπαγετώδη καταφύγια. Κατηγορίες ειδών. Μοντέλα παρελθοντικής και μελλοντικής προβολής. Διαχείριση Τριτογενών υπολειμμάτων

Φυτικά είδη εισβολείς: Εισβολές φυτών στην Μεσόγειο. Διαχείριση φυτικών εισβολέων.

Βιολογικοί δείκτες ρύπανσης και περιβαλλοντικών αλλαγών: Οι λειχήνες ως βιολογικοί δείκτες, Άλλες κατηγορίες φυτικών οργανισμών, Βιοπαρακολούθηση.