Τομέας Βιολογίας Οργανισμών, Πληθυσμών, Περιβάλλοντος και Θαλάσσιας Βιολογίας

Οι κύριες ερευνητικές δραστηριότητες σε αυτόν τον Τομέα εστιάζονται στη Βιοχημεία και Μοριακή Φυσιολογία Φυτικών Οργανισμών, στη Μοριακή-Αναπτυξιακή Βιολογία Φυτών, στη Φωτοβιολογία και Βιοενεργητική, στη Πράσινη Βιοτεχνολογία, στην Οικολογία και Διαχείριση Χερσαίων Οικοσυστημάτων, στη Συστηματική, στη Γενετική πληθυσμών, στην Εξελικτική Βιολογία και στη Θαλάσσια Βιολογία. Ερευνητικές ομάδες από τον Τομέα συνεργάζονται με άλλες ερευνητικές ομάδες από άλλους Τομείς του Τμήματος Βιολογίας, του Τμήματος Χημείας και  του Μουσείου Φυσικής Ιστορίας του Πανεπιστημίου Κρήτης, με το ΕΛΚΕΘΕ, το ΙΜΒΒ, αλλά και με ερευνητικές ομάδες από άλλα Ερευνητικά Ιδρύματα της Ελλάδας και του εξωτερικού. 

Τομέας Βιοτεχνολογίας και Εφαρμοσμένης Βιολογίας
Η έρευνα σε αυτόν τον τομέα εστιάζεται στις εφαρμογές της οργανισμικής και μοριακής βιολογίας και συγκεκριμένα σε προβλήματα που σχετίζονται με την Ελληνική οικονομία.  

Τομέας Βιοχημείας, Μοριακής Βιολογίας & Βιολογίας Κυττάρου & Ανάπτυξης
Οι ερευνητικές δραστηριότητες σε αυτόν τον τομέα εστιάζονται σε μοριακά και κυτταρικά θέματα στα θηλαστικά, στα φυτά, στα έντομα και στους μύκητες.